老年病科是濟寧地區首家開展各種老齡慢性病治療科室，科室以老年醫學為特色，開展老年綜合評估，進行各類老年內科疾病預防、診治及后期康復，并擅長中毒及缺氧性疾病等診治。有多病同治或主治一病、兼治其余的特點。設有康復區，有電動起立床、功率自行車等設備，有專業康復師提供技術指導，集醫療、康復、保健指導為一體。科室擁有24小時血壓監測、心電遙測、心電監護儀等醫療設備，并有鄒城地區唯一的10座以上高壓氧艙，
職業病科室在呼吸系統疾病、消化系統疾病和職業性疾病診治方面有豐富的臨床經驗，是兗礦集團唯一指定的職業病收治定點醫療機構。作為鄒城市最早開展無痛胃腸鏡的臨床科室，在無痛胃腸鏡檢查和鏡下治療方面有較大影響力，在濟寧地區率先取得兒童內鏡操作許可證。
濟寧市重點專科，目前是中國肝炎防治基金會授予的“核苷經治患者特色門診”、“干擾素臨床實踐基地”、“乙肝臨床治愈項目醫院”，同時也是山東省感染發熱疾病診療專科聯盟常務理事單位，是兗礦集團唯一定點收治傳染病及各類肝病的特色專科，
兗礦新里程總醫院健康管理中心的前身是兗礦集團總醫院體檢中心,位于鄒城市公園路，成立于2005年，經過2015年、2019年兩次大規模升級改造
康復醫學中心是中西醫結合、醫教研一體的綜合科室，濟寧市重點專科、康復醫師轉崗培訓基地、濟寧市康復專科聯盟、齊魯康復聯盟、鄒城殘聯定點醫療機構。
兗礦新里程總醫院在東院區開設的醫養結合機構，是濟寧地區長期護理險定點服務機構。本中心以三甲醫院強大醫療技術力量為依托，主要為失能、半失能老人提供專業的醫療護理和全面的生活照護。
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